不过有一点是对佐竹家非常的不利，那就是新招募的这四千士卒都是普通的农兵而已。（）之前他们是完全没有上过战场的，也没有任何的作战经验，从来没有拿过枪，见过血，根本可以说是辣鸡。
之前经过了月折山合战的两千余逃回来的士卒，现在已经都被黑田家的大军吓破了胆。他们根本就不敢和黑田家的士卒一战，已经是完全没有士气了。对于他们来说，黑田家的战斗力实在是太过于恐怖了。
黑田家的三万大军对太田城进攻了包围，只不过几次攻击都没有能够取得突破，佐竹家的守军反倒是提高了不少的士气。
黑田家暂时没有任何的办法，这个时候还是后藤基次站了出来，他在观察了周围地形之后发现，太田城的西面、东面、南面全部都被河流所包围，那是一座在河流汇集处建立起来的城市，周围地势一点都不高。
后藤基次马上自己到附近查看了情况，之后立刻来到中军幕府，求见这路大军的总大将母里隆友，并且将自己的想法告诉给了他，这个办法立刻引起了母里隆友的重视，并且将后藤基次的攻城办法，告诉给了麾下的众人一起进行商议。
所有人都同意了这个办法，只不过中间还有一些细节需要商议，于是在经过了一番没有什么太多异议的讨论之后，众人都同意了后藤基次的办法，之后黑田家大军开始了对于水攻的准备工作。
这是一个比较大的工程，需要在两条河流的上游进行截流，不但黑田家的人马参与了工程，最后还通过钱粮的方式，对周围的百姓进行了谱请，才达到了预定的目标。
在经过了大概半个月的准备时间之后，由总大将母里隆友自己亲自动手，揭开了太田城上游河流的拦截大坝，河水犹如千军万马一般，对着太田城的方向奔流直下，并且快速的将太田城外围的各种阵地，和人马全部都给冲的七零八落。
而且经过了这一次的水攻之后，太田城内的粮食也受到了非常大的损失，在城中目前有六千守军的情况下，还加上各种城中的百姓，每天都有当时的粮食消耗，这是不能够避免的事情，更何况现在他们自己还全部都泡在水中间呢。
最后在围困了一个月之后，佐竹家终于受不了了，在黑田家的要求之下，佐竹义重带着家中的几个一门众出城，在黑田家大军面前切腹自尽，以换取城中所有居民的安全，这也得到了母里隆友的同意。
看到关东大名佐竹义重都要切腹自尽，上杉景胜和直江兼续非常的庆幸，他们庆幸自己没有继续