高兴的时候，参谋来向他报告：“有一个西班牙人，自称是西班牙帝国的谈判特使，要面见您。”
林飞没有意外，让人把他带进来，时候不大，林飞部下战士带着巴拉克总督来到林飞面前，巴拉克总督有了大英帝国撑腰，说话硬气了许多，直接对林飞说道：“我是西班牙帝国的特使，我需要立刻见到英国特使，我们三方共同商讨停战事宜。”
林飞冷笑一声，说道：“你们的马尼拉已经被我打下来了，你们还哪有什么谈判筹码？”
巴拉克总督冷声说道：“马尼拉虽然沦陷，可是吕宋岛的其他地方还在我们西班牙帝国的掌握之中，我们的桑德斯总督也没有被你们抓住，我们在本土还有数以十万计的军队，这些不都是我们的谈判筹码吗？”
林飞不屑地笑了笑，冲部下说道：“带他去见克拉罗斯吧。”
参谋何凯生小声劝道：“陛下，真的要让巴拉克总督和克拉罗斯见面吗？让英国人和西班牙人联合起来对付我们，是不是不太好？”
林飞笑道：“就算我们现在不让巴拉克总督和克拉罗斯见面，也会有别的西班牙人和英国人见面，然后来找我们，我们不让巴拉克总督和克拉罗斯见面不仅没有用处，反而会显得华夏帝国不够大度，让我们以后的行动十分被动。”
何凯生这才明白，答应下来，带着巴拉克总督去见克拉罗斯，克拉罗斯此时也在军营里，林飞给他们安排了几个帐篷，让他们在里面居住，并且派了几个战士留在他们身边，明为保护，暗为监视，克拉罗斯对此并没有什么异议，他也知道城中正在打仗，留在城中很不安全。
在何凯生带巴拉克总督去见克拉罗斯的这段时间里，林飞继续指挥部队向马尼拉全城扩展，7月9日下午5点，林飞部队占领全部马尼拉市区，自此，马尼拉战役宣告结束。
这场战役从6月13开始，到7月9日结束，历时27天，是整个菲律宾战争中持续时间最长、参战人数最多、动用武器种类最多的战役。
这场战役主要分为三个阶段，第一个阶段，林飞使用云爆弹攻击西班牙守军第一道堡垒，并派出步兵对第一道防线进行攻击，结果云爆弹大显神威，西班牙人精心准备的堡垒被攻破，林飞部队占领第一道防线。
第二个阶段，林飞使用攻心战术，对第三道防线内的华人士兵进行策反，使得大批华人士兵战场倒戈，这些士兵随后成了林飞的“第五纵队”。
第三个阶段，林飞运用炮兵，炸开马尼拉的城墙，派遣