进入了锦州城内的临时大本营所在地之后，朱由检便让众人先行散去，只带着孙承宗等总参谋部的参谋们进入了官署。而海兰珠则带着侍卫们进入了后院，为崇祯安排下榻的地方去了。
坐在了官署中收拾出来的会议室之后，朱由检便要求总参谋部对整个宁锦作战进行一次详细的汇报。花费了一个多小时听完了众人的汇报之后，朱由检便不客气的对参谋们说道：“这么看来，之所以会出现宁远守军受骗出击的事情。
一是总参谋部在辽西镇推行的参谋体制没有得到落实，所以满桂将军才会轻信一个叛逃后金的军官，而不是从参谋官那里得到是否应该救援锦州的意见。
二是年初的肃反行动力度看来还不够，还不能够震慑同后金有勾结的内部叛徒，所以这些人才敢同后金勾结，蒙蔽了满桂将军。
在京城的时候，诸君交上来的军事演习计划看似条理清晰，算无遗策。可是现在后金只是一次试探性的进攻，你们的计划就立刻支离破碎，难以执行了。一个没有执行能力的计划，和没有计划又有什么区别？”
崇祯的责备，顿时让之前心情刚刚有所开朗的参谋们又紧张了起来。他们完全想不到，该用什么样的语言来为这次的作战失利辩解。毕竟他们此前向皇帝送去演习计划的时候，可是信誓旦旦的保证过，他们已经将后金军队的一切反应计算在内了。
然而等到总参谋部的成员们出了山海关之后，他们才发觉之前一直汇报发展良好的辽西镇参谋组织，除了后勤部门之外，其他方面也就是一个样子货而已。
他们所制定的演习计划并不能按部就班的执行下去，因为各支军队中的参谋人员还无法通过一纸文书调动整支部队行事，必须要同一个个大小军头进行协商和谈好行动的条件。简单的来说，总参谋部在新军中如臂指使的指挥权力，在辽西诸军中根本行不通。
在这里，即便是最为拥护朝廷的满桂所部，没有满桂的点头，总参谋部的命令就无法落实下去。当然这是指作战方面的命令，至于后勤部门因为脱离了各军成为了独立单位，反倒是最为服从总参谋部的指令的。
辽西镇的军队分成了五个部分，何可纲率领的祖家军实力最强，其次是皇帝最为支持的满桂军，再次则是张春、朱梅和孙祖寿三部。孙祖寿乃是从昌平调任的山海关总兵，其军队组织算是最为接近于新军的了。
孙承宗不得已，不得不把责任揽到了自己身上，向皇帝再次请罪，承认了自己失职的过错。朱由检这次