上的秩序，好即刻恢复生产。但是当日军进入了邦板牙人的传统居住地之后，失去了四海贸易公司代表约束的日军，立刻将战斗变成了对反抗者的屠杀。
在这些来自日本国内旧武士出身的军官眼中，这片富饶的土地让这些愚昧的土人占据着实在是太浪费了。特别是他们已经获知，在这场战争结束之后，日本将会在吕宋岛上获得一片土地作为战争赔偿后，便开始有意识的对土人进行了清理。
向来自诩勇敢的邦板牙人，在装备了先进枪炮的日军面前，这种野蛮人的勇敢只会带来整村整村的灭绝。和人口数量不足的西班牙殖民者相比，日本人根本不在意是否留下一些土人来为自己耕作劳动，他们对邦板牙人开发出来的土地更感兴趣。
在连续十多个村子的被屠杀之后，邦板牙人终于意识到，和日军的凶残相比，西班牙人和中国人的统治简直可以称的上是仁慈的。邦板牙人在西班牙人和中国人之间并没有选择谁的权力，他们要么接受统治，要么选择死亡。
当日军从三个方向包围了甲万那端之后，邦板牙部族联盟的首领们终于决定向四海贸易公司投降，以获得公司的保护。只有极少数部族首领因为反对投降退出了联盟，带着自己的部族迁移到了东北方的崇山峻岭之中。
真田幸昌和毛利胜家并没有在甲万那端多加停留，他们留下了一个联队驻守此地之后，便带着主力沿邦板牙河而下，直接扑向了马尼拉湾，准备一鼓作气将马尼拉王城边上的内湖平原也拿下来。
12月份，日军2个联队2千余人首先抵达了马尼拉东北约10公里处的马里基纳河边。马里基纳河是流经马尼拉王城巴石河上游的一支分流。渡过了这条河流，南方便是西班牙人经营了上百年的内湖平原，也就是菲律宾殖民地的精华地区。
不过当日军预备搭建浮桥从此处渡河时，马尼拉城内的西班牙人终于忍耐不住了。和美洲殖民地的社会结构差不多，马尼拉城内虽然有着上万人，但是从国内而来的半岛人只有八百余人，其次是2千多土生白人，接下来是西班牙混血人口和其他欧洲人，还有为他们服务的黑奴。
和30多年前相比，马尼拉王城的人口几乎增长了十倍，这也是科奎拉总督敢于仿效前总督阿库那，试图再一次清理菲律宾迅速增长的华人人口，并企图劫掠华人财富的底气。
但是他没能想到是，和前一次毫无组织的八联华人相比，以国家为后盾的四海贸易公司，反应迅速的把一只舰队放在了马尼拉王城的门口，迫使马尼拉