孙传庭最终弄明白了崇祯皇帝的意思，那就是皇帝想重新启用他，让他去提督陕西、河南军务，剿抚越演越烈的流寇之患。
这三年的牢狱生活，已经让孙传庭性情大变，他以往的性格，也只体现在了初见崇祯皇帝时候那一句带着怨气的问询上，后面都是顺着崇祯皇帝的意思说话。他当然不会拒绝再一次改变命运的机会，没有任何推拒，也没有任何扭捏，就接受了崇祯皇帝要他能临危授命，前往河南剿灭流寇的授意，拍着胸脯保证，只要他孙传庭还有一口气在，一定替皇帝剿灭流寇，荡平建奴，还天下以安宁。
崇祯皇帝也很果断地恢复了此前孙传庭了职位，兵部右侍郎兼右佥都御史，并提督河南、陕西军务。在当场宣布了此任命后，崇祯皇帝也问了孙传庭，需要调遣何部人马。
在和崇祯皇帝对言间，孙传庭已经基本了解了这几年大明官军与建奴，还有与流寇之间的争斗情况，对这些年的战况也大概了解，主要的总兵官的战功也有些数，听崇祯皇帝这样问，他考虑了一下后，也直接回答了：“希望陛下能将曹变蛟所部划归臣所属，再将大同曹越所部交给臣指挥，其余人马，随陛下划拨，臣没有特殊要求。”
“好，朕答应你的要求，即令曹变蛟率部入关，且你平定流寇，不过，”崇祯皇帝顿了顿后，语调一转，“曹越的大同军朕可以交给你，但曹越却不能随你一道去河南平叛。”
“这是为何？”孙传庭一头雾水，弄不清楚崇祯皇帝此举是因为什么。
曹越和曹变蛟的战功是摆在那里，这兄弟是如今大明最有实力的战将，曹变蛟不用说，孙传庭见识到过其功，差点把李自成追的走投无路，最后只率十八骑逃走。但曹越却是没见到过，大同军是曹越一手训练出来的，要发挥最大的战斗力，肯定由曹越指挥为好，换成其他将领，战力肯定会大打折扣。而且孙传庭也对曹文诏的这个儿子非常感兴趣，很想亲自见识一下曹越指挥作战的手段。
崇祯皇帝却不想让曹越随他一起出征河南，孙传庭当然不得其解。
“朕已经准备让曹越当朕的驸马，将坤兴公主下嫁与他。朕想让他在完婚后，提督京营，大同交由其他人镇守，所以，他不能随你出征!”崇祯皇帝说话间一副意味深长的神色。
孙传庭刹那间就明白过来崇祯皇帝的意思，这皇帝老儿虽然说的好听，就像非常宠信曹越一样，要给曹越更高的待遇和职位，但摆明了就是要摘桃子，夺曹越亲自训练出来、战斗力非常强大的大同军，还想