“怎么可能会这样呢？”葛城美里本来就觉得昨天的梦很奇怪，今天上班就发现有人说起梦来，竟然发现他们做的梦都是一样的。
这就是大事了，美里又问了几个同事听到了同样的一个梦境。他们都不知道是什么意思，不过他们都做出了选择。
连碇源渡都做了这个梦，所以今天他脸色凝重，梦的内容竟然是关于整个世界未来的走向，恐怕和‘人类补完计划’有关。如果那些末人知道了‘人类补完计划’，以他们卑微的思想是不会明白计划的伟大，他们一定会害得人类失去最佳的机会，也害碇源渡白费努力。
冬月看着碇源渡的脸色，虽然他的脸色一直很差不过今天特别差，所以冬月知道恐怕碇源渡昨天晚上也做了这个梦。
“碇，这代表什么？”冬月不解地问道。
“是超人。”碇源渡的直觉告诉他，真正让事件变得如此复杂的只有那个家伙，如果没有超人一切都会按照他的计划进行。
冬月也没有反对这种猜测，因为他也觉得和超人有关：“可是他到底要干什么？”“如果能交流的话就好了。”虽然飞船就在头顶上，可是却没有任何对话的意思，这才是最难办的。
“他会有动作的。”既然不能交流，那么只能等待了，碇源渡已经等了十年了，他还能继续等。
肯特为了掩盖给伽娜塔的惊喜，可是大动干戈地转移伽娜塔的注意力。
从梦境调查的结果，肯特挑选了一些人作为培养皿，稍微借了莉莉丝的一点灵魂，将灵魂碎片和S2机关雏形植入其中，将他们变为‘农田’。
伽娜塔打开传送门将肯特送到世界各地忙碌，她还是一头雾水，不过很乐意帮肯特的忙。
全部完成了，现在就等晚上开始行动了。
于是这一次被挑选的人又开始做了梦，梦里有苍天的世界树和强大的使徒，起初世界被使徒占领，然后获得智慧的远古人类站了起来，远古人类体内的灵魂和使徒灵魂相差无几，所以以雷厉风行的手段和使徒展开了搏斗。
最后使徒和人类都在陨石的轰击中结束，但两者的缘分却还没有结束。因为使徒和人类只有一方才能获得最后的胜利，只有他们中的一方能完成融合进入新的世界。
斗转星移，沧海桑田，人类忘记了自己也是使徒之一，体内的灵魂也与使徒灵魂大相径庭。现在使徒回归又到了末日临头的关键，一部分受到宣召的人重新分得了使徒的灵魂，他们将站在人类历史的十字路口