一、筑基
筑基为内丹修炼的准备阶段，也可看成是第一阶段。要求填亏补虚，炼好身体的精、气、神三宝，炼养得充盈，达到精足、气满、神旺的“三全”世界。就好比建筑高楼首先要打好地基，一般要经过一百天的时间，故称“百日筑基”，其实不一定每人都须“百日”，有人可能长一些，有人可能短一些。
筑基的关键在于“炼”，就是要把自己思想上的杂念尘垢，拂拭得干干净净，一尘不染。明代伍冲虚《内炼金丹心法炼己》：“己即我静中之真性，动中之真意，亦为元神之别名也。”
炼己的方法是断除声色，省却应酬，使耳目归于清净，杂念消于未萌。炼己的过程，即是筑基的过程。只有收视返听，清心寡欲，才能培炼元精、元气、元神，达到三全境界。
二、炼精化气
炼精化气，又称小周天、百日关，即将精与气合炼而成为气，达到“三归二”。是内丹修炼的第二阶段。其法初步是贯通任、督二脉，打通“小周天”。即用意念的力量使精化气，复使气自会阴、尾闾溯夹脊上达泥丸，再下降丹田，如此反复运转，称为“河车通”。
炼精化气又称“初关”。具体功法即“小周天”。因炼精化气小周天以意领气的循行和后天八卦有关，而后天八卦又以坎离代表人体心肾、水火，在十二地支为子午，在方位为南北，所以“小周天”又有“坎离**”、“取坎填离”、“水火既济”、“心肾相交”等名称。小周天亦称“子午周天”。
小周天功就是要通过子午周流，打通任督之法，取坎填离而为乾坤，恢复先天八卦元气。小周天功法又分以下层次。
1、调身：修炼周天功一般采用坐姿，又分双盘坐、单盘坐、自然坐几种。
调整坐姿后，挺直腰背，放松全身骨肉，微闭眼睛，合上双唇，舌抵上腭，调匀呼吸，处于自然状态。
亦可采用仰卧身姿，枕头不宜太高，以２寸为宜。其它要求同坐姿。
2、调药：“药”指精、气、神，调药即调精、调气、调神。精气调，则精满自然化气，气满自然生精，精满气足则神自然旺。
调药的关键在于“凝神入气穴”，凝神即澄神息心，使意念若有若亡，气穴即下丹田。意念、神气澄息后凝聚于下丹田。
凝神入气穴，且感到活子时来到，说明药物已在下丹田产生，后天之精转为先天之精。
3、产药：周天功所产药物，一般分为外药、内药、大药三种。