所以拥戴的缘故，想不到司马昱一见到他，就流泪不止，桓温顿感惊愕，这样的场面可真心是始料未及，一肚子备好的话竟连半个字也说不出来了，一种名叫怜悯的情绪油然而生，眼眶也跟着红了起来，为了躲开抱头痛哭的尴尬，赶紧告辞离开。
出于对司马昱的同情，桓温放弃了郗超提出的逼宫计划，转而为另外一种各自相安无事的禅位模式做准备，但郗超提醒他司马昱尚有儿子，禅让一事并不能百分百保证实施，桓温思量许久，还是不忍对司马昱动粗。
司马昱最早娶了王述的堂妹为王妃，生了世子司马道生和司马俞生，但司马道生的品德太差，母子都被废黜囚禁，后来死在囚室，其余三个儿子司马郁、司马朱生和司马天流，也早夭亡。
之后长达十年间，司马昱的妃子们竟没有一个怀孕，司马昱不得不请一位资深的面相学专家，到后院察看所有的妃子，还看了所有婢女，专家转了一圈，最后把视线放在一个纺织室的女婢身上。
这位婢女名叫李陵容，是从马来半岛过来的，皮肤黑而身材修长，宫里人都称她为昆仑，专家拍手道：“能生皇子的就是她了!”
司马昱只觉无语，但为了延续子嗣，还是让她陪宿，结果真的连生两个儿子，即司马昌明和司马道子。
次年7月28日，11岁的司马昌明被立为皇太子，司马道子则被封为琅邪王，兼管会稽国，奉祀祖母郑阿春的香火。
这两个孩子都还未成年，桓温倒并没在意，太宰、武陵王司马晞，是司马昱的弟弟，平时不务正业，却尤喜欢练兵为乐，桓温担心他惹出什么幺蛾子，特别上疏指控他聚集地痞流氓，包藏祸心，他的儿子司马综也傲慢残忍，当初袁真叛乱，他们就曾互相勾结，近来私下动作频频，将要发动政变，请免除其官职，暂以亲王身份返回王府。
大司马既已发话，司马昱当然只有批准的份，于是连同司马综等人一并免职。
这之后，桓温上了瘾了，把得罪自己的人全都收拾一遍。
当初殷浩死的时候，桓温还特意派人带着信件前去吊丧，结果殷浩的儿子殷涓既不答礼，事后也不晋见桓温道谢，却跟司马晞来往交游，桓温为此恼了好久，另外广州督导官庾蕴等人，一向与桓温不和，桓温对他们也都没好感，如今基本操控了朝廷，正式对这些人展开报复。
371年11月17日，桓温派弟弟桓秘，肋迫新蔡王司马晃、前往太极殿西堂叩头自首，招认与司马晞、司马综、殷涓、庾倩、曹秀、刘