现代人从各种忍术秘本中，所得知的忍术武器有：『手里剑』、『撒菱』、『忍刀』、『吹矢』、『忍杖』、『手甲钩』、『水蜘蛛』、弓箭『苦无、『闻金』、『坪锥』、『问外』等。
『手里剑』类似飞镖，十码之内可百发百中。一般有八方手里剑、六角手里剑、十字手
里剑、三角手里剑以及“卍”字型手里剑，这些手里剑掷出去后，在空中会围绕其几何中心旋转，因此轨迹稳定，在近距离能够保证一定的精度。多角型手里剑主要依靠锐利的角杀伤敌人，杀伤力有限，所以忍者会在每个角上都涂上剧毒，是很危险的武器。手里剑的重量在40克至60克间，一般忍者也不会携带几十枚，毕竟身轻如燕是他们的优势之一嘛。
许多人印象中总以为忍者每次出任务都是以黑衣蒙面的姿态出现，其实是受到武侠和电影的“物像化”影响。这种黑色的衣服也并不一定总是所谓的“忍者制服”。事实上古代日本的老百姓在工作时也经常穿著这种黑色的工作衣，那是一种日本古代的工作衣。而当忍者在暗夜人静时能方便执行任务上的隐秘需求，才特别穿著这种染黑的工作衣，而在工作衣上有特别的一些修改，以符合任务及作战上的需求。
真正的忍者经常在出任务时不会像和电影所叙述的总是以黑衣蒙面的姿态出现，且经常化妆成各式各样的社会人士或各行各业的角色混入一般人群之中，作为自我身份的掩饰。例如乞丐、化缘和尚、技艺杂耍表演人、路边小贩、武士、浪人、修道士、江湖郎中等等不定的角色。某些忍者跟现代的情报员、特务的形态类似或一样。
其最为不同之处在于多了一项就是“忍术”的训练”。
忍者其所呈现的是属于“派系组织性的单位”形态。而这种“组织性的单位”有很多门派分布在日本各地，有官方及非官方性质的。基本上“忍者”这种产物的诞生其因素完全和日本古代“战国时期”这种客观环境有很大的关系。
日本古代“战国时期”就如同早期中国的“春秋战国时期”一样，城邦分立，各自为政。到处都是兵荒马乱和充满血腥残酷的杀戮及无情的战火。而这些争权夺利互相斗争的诸侯及军阀们非常的迫切需要培养一批专业化的渗透部队能快速潜入敌后进行侦查、刺探、暗杀、扰乱及破坏等的间谍任务。“忍者”就是在这样充满动乱的险恶大环境中诞生出来的。
而早期这些诸侯军阀们所培养出的“专业化渗透部队”在初期事实上并非就有雇用到“忍者”，只