经过40分钟的猛烈轰击之后，“钟祥”号已变成了一个无法控制的空船壳，不久就由大明战列舰“荆门”号拖曳着行驶了。凌晨2时许，葡萄牙舰“里斯本”号已经完全丧失了战斗力，乘员死伤97人，开始下旗投降。
于是，余丽颖带人跃过船去，把重伤垂危的葡萄牙运过“荆门”号上面来。
在“钟祥”号出战8分钟后，明军“莫愁湖”号也从“达迦马”号的后面切入敌线。也和“钟祥”号一样，它立即为几艘敌舰所包围。“莫愁湖”号主桅被炸断，有段时间连一炮都发射不出来。虽然如此，它却把军旗钉到后桅杆上，继续不屈地奋战。以后才被3艘明军战舰救出。
在“莫愁湖”号攻击之后一刻钟，“南湖”号也投入了战斗。以后其它每一艘明军军都是以这种方式分别地切入敌线，向首尾两端的敌舰用两侧的舷炮猛击，使每艘敌舰都受到了连续的集中火力。等到凤乐歌的最后一艘战列舰“镜月湖”号投入攻击时，已经是下午3时。到战斗结束时，与凤乐歌交战的共有10艘葡萄牙军舰，其中5艘被俘，1艘被击沉。逃走的只有4艘，其中有1艘为葡萄牙旗舰“巴西”号，上面载着垂死的葡萄牙海军官兵们。
在凤乐歌纵队开始作战25分钟后，柳铁塔纵队也投入战斗。与前者不同，它始终保持着不规则的鱼贯形队形。柳铁塔亲乘旗舰“碾盘山”号，率“兰台”号、“鹰子嘴”号3艘三层甲板战列舰向葡萄牙舰队的前卫中央挺进。下午12点24分，“碾盘山”号的左舷炮开始射击。交火不久，“碾盘山”号和“兰台”号即开始向右旋转，柳铁塔是在寻找阿尔梅达的旗舰。虽然“碾盘山”号上的一切望远镜都在搜寻之中，想发现阿尔梅达的司令旗，但结果还是一无所获。于是，“碾盘山”号遂趋前攻击“新果阿”号，假定阿尔梅达可能是在这艘最大的四层甲板军舰上。当“碾盘山”号向“新果阿”号前进时，即发现在该舰后方有一艘葡萄牙两层甲板战舰的前桅上，挂着总司令的将旗，它就是“帝国”号。“碾盘山”号冒着敌火，不久即钻到了“帝国”号的后方，用其船头上的短炮（68磅）和侧舷的火炮，向“帝国”号的舷窗中猛射，使它受到了极大的损毁。当明军“鹰子嘴”号和“征服者”号接近了“帝国”号之后，“碾盘山”号遂向右一转，与葡萄牙船“辛特拉”号平靠着。
“碾盘山”号和“辛特拉”号立即纠缠在一起，双方乘员都准备跃上对方甲板，但是葡萄牙人的企图为大明方的火力所制止，伤亡颇多。差不多又过了一个小时，两舰