在大明军队的攻击下，葡萄牙人在赛巴图尔修建的城墙被大明的火炮炸塌了。葡萄牙士兵躲藏事先修好的土木工事里，不敢露头。
葡萄牙的步兵营营长格雷罗带领四百名葡萄牙勇士，冲向城墙缺口处，希望用自己的血肉之躯来阻挡明军。结果，明军用榴弹发射器将他们直接轰倒。没被炸死炸伤的葡萄牙士兵都躺在地上装死。明军使用向地方的士兵不断射击，同时用手雷和榴弹对他们进行着清理。那些装死的葡萄牙士兵只好跳起身来，然后他们一个个像猎物一样被明军被打死。
明军的炮弹摧毁了葡萄牙士兵的木制工事，葡萄牙军人大量修筑土质工事也被炸得面目全非。城内的房屋被大明的炮火点燃，烟火影响了进展。
何宁远命令大明的舰炮算好角度，对准赛巴图尔城内一阵猛轰，城外的重炮也不断将炮弹打进赛巴图尔城。猛烈的炮火袭击，相反让城内的火灾变得好多了。但是，烟雾更大了，葡萄牙士兵受不住烟雾的熏呛，他们纷纷往外跑，结果他们成了明军的活靶子。
躲在临时工事墙后和运粮车后的葡萄牙士兵不断用火绳枪向明军打冷枪。但明军一旦受到袭击，立刻用榴弹发射器轰击。结果，工事后的葡萄牙人被炸得鬼哭狼嚎，不断惨叫。
明军与葡萄牙守军展开了巷战，但是他们已经掌握了绝对优势，晕头转向的葡萄牙士兵在明军的劝诱下，开始大批投降。躲藏在地下工事内的帕特里西奥爵士，眼见守城无望，在绝望之下，他的手下挑着白旗走出藏身所，向明军投降。在得到明军的安全保证之后，帕特里西奥爵士也向明军投诚，同时吗，他号召巴图尔城内的葡萄牙人都交出武器，不要再抵抗明军。
葡萄牙军队接受了命令，他们集体向明军投降，在明军的帮助下，他们扑灭了城内的大火。
何宁远进入了赛巴图尔城，在这里他举行了盛大的进城仪式。何宁远告诉欢迎他的葡萄牙百姓；“你们盼望已久的和平即将到来，下一步我们即将进入里斯本。到时候，整个葡萄牙将沐浴在大明嘉靖皇帝的慈爱统治之下，你们将不再担心苛捐杂税和邻国的侵略，迎接你们的只有和平和福利。”底下听讲的人们爆发出一阵热烈的掌声。
明军在里斯本附近获得一个稳定的落脚点的同时，其他三路明军也势如破竹的攻进了葡萄牙国内。
甄达钱则率领六万军队越过边境直取坎盖马约尔，柳亦菲的十五万部队则直扑维苗苏，朱三勇则带兵九万攻克了皮涅尔拉。
由于实力太悬殊