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看到朝庭兵马来到，乱民胆气尽丧，在轻骑的追逐下竞相逃命，刘敬宣斩获千余人。
刘裕一人驱逐数千人的战绩很快在北府军中传扬开来，一战成名。
刘牢之与刘敬宣父子夹击虎疁，虎疁守军大败；紧接着刘牢之兵陈吴郡，与陆瓌交战，陆瓖兵败后逃往会稽。
十二月十六日，谢琰攻陷吴兴郡治乌程，刘牢之亦率得胜之师自吴郡南下。
谢琰坐镇乌程，派府司马高素率军与刘牢之在钱塘江北岸会合，准备渡江攻打会稽城。
建康，司马元显收到刘牢之攻陷吴郡的消息，张法顺建言不宜追究刘牢之擅自出兵之责，索性诏令刘牢之都督吴郡军事，并将其辅国将军提升为二品的前将军。
刘牢之尝到了拥兵自主的甜头，朝庭对手握兵权的将领实际上已经没有能力约束，只有通过朝庭的名义在官职上加以约束。
会稽城，孙恩得知朝庭兵马集结在钱塘江之北，安慰麾下道：「我等只要保住浙江，不失为越王勾(句)践。」
十二月二十六日，刘牢之率北府军渡过钱塘江，直逼会稽城。
孙恩闻讯，道：「胜败兵家常事，逃走算不上羞耻。」
在大军到来之前，孙恩率领二十余万乱民，带着大量的财物向东撤走。
高素率军追至山阴，斩孙恩所委吴郡太守陆环、吴兴太守丘汪、余姚县令沈穆夫等人，首级送往建康示众。。
为避免北府军趁机追杀，孙恩下令将收集的珍宝沿途丢弃，并将战力不足的儿童、女人驱逐出队伍。
面对「粲丽盈目」的宝物，北府军将士疯狂争抢，孙恩率部由曹娥江口逃归海岛。
谢氏族人为了报仇，大规模搜索孙恩余党，追讨、手刃冯嗣之等人。官军到处，军纪荡然无存，刘牢之等人放纵军兵烧杀抢掠，士民无不失望，残余的百姓纷纷避入山中。三吴郡县，一片荒凉，百里不见人踪。
孙恩败退，司马元显以徐州刺史谢琰为会稽内史，督五郡军事，率徐州文武官员，分北府军万人，坐镇会稽，刘牢之部将桓宝被留在三吴。
刘牢之领剩下的北府军回归京口，刘敬宣向其父表刘裕之功。刘牢之向朝庭请功，刘裕升为四品广武将军，在北府军中统领两千兵马。……
皇甫敷兵败盘龙山，带着残兵败将退守
襄阳城，清点残军不足二千人。
接到皇甫敷的急报后桓玄大惊失色，不过此时他亦无法抽