新一代的毁灭性病毒时，网络上最为致命的战斗就打响了。其中一些代码甚至在创造者身故多年后仍在运行，在网络空间中留下了大片无法修补的黑暗区域。
2022年6月，军用科技集团与荒坂集团都认为无需再拘泥于外科手术式的小规模行动，冲突进入了第三阶段，热武器战争。两家公司间的冲突飞升为全面战争。部分城市，如里约热内卢惨遭夷为平地，城里的居民要么被杀，要么背井离乡成为难民。
全球贸易由于军事行动和市场崩溃而陷入瘫痪。国际贸易路线遭到了沉重打击，盗版横行，肆无忌惮。当现实中的冲突烈火燎原之时，网络监察也在尽力保护网络空间的安全。然而，由于全球服务器群组与数据库的损坏，加之数以千计的病毒破坏，于是，正如我们所知的那样，网络空间逐渐消亡了。
最终，世界各国厌倦了企业间的冲突。一些国家的政府开始公开指责军用科技集团和荒坂集团应为当前的形势负责，并且撤回了对两家公司的支持，同时对其将其本国的资产国有化。南加州自由州查封了两家公司位于洛杉矶的总部。德克萨斯州与一些欧洲国家也紧随其后，相继实施制裁行动。
位于夜之城的荒坂塔是荒坂集团在美总部中最后一个沦陷的。该塔被一枚由不明佣兵集团引爆的战术核武器抹去。有消息表明所谓的“亚特兰蒂斯集团”也牵涉其中，该集团的成员包括：已经成为都市传说的罗格、摩根·黑手以及强尼·银手，但并无足够的证据来确认该集团参与了此事。摩根与强尼在荒坂塔事件后再未现身，而罗格则多次否认参与过该行动。
2023年末，在日本政府的施压之下，荒坂最终承认战败，军用科技集团获得胜利，但与他的对手一样损失惨重。
办公司里，军用科技的特别行动主管梅瑞狄斯·斯托特双手环抱身前，一脸严峻的说道：“情况大概就是这样，有一伙不明身份的家伙偷走了公司的军用机器人，并且投入到了太平洲的帮派战斗中去，上头已经交代下来了，不论如何都找出这伙人。”
一众下属：“是！”
“好了散会，佐伊，你留下。其他人出去。”
“佐伊·弗雷，弗雷家族的三女，父亲戴蒙·弗雷是国防部的高官，大哥霍斯特·弗雷，军用科技董事会正式成员，二哥哈里·弗雷，夜之城市议会议员。我说的没错吧？”
“没错....梅瑞狄斯主管。”
“像你这样的家世背景，老老实实在家当个大小姐不就好了吗，怎么想