五月中旬，距离晋帝司马昌明驾崩七日后，朝廷追谥司马昌明为孝威皇帝，庙号高宗，以此纪念其统领晋朝击败苻秦百万大军南侵，收复徐、青、兖、豫四州诸郡的功绩。
晋廷将孝威帝安葬在隆平陵，百官及百姓以日易年举丧三日，新帝着丧服三十六日，以日易月，以示晋廷以仁孝治天下。
同时，晋廷在王珣、王恭、徐宗文、王国宝四位辅政大臣的主持下任命虎威将军谢琰为平吴将军，监三吴诸军事，率禁军龙骧、虎威、左羽林三军营出征平孙恩天师道之乱。
晋廷中书省下达诏令，调镇守洛阳的骁骑军中五千狼卫南下护卫京畿建康，划分石头城与西州城之间的冶城为暂时驻地，徐宗文命鹰扬将军诸葛侃、原虎威将军现在的靖远将军郑略二人统帅狼卫南下。
在徐宗文的建议下，所有刺史与都督不准入京，仅允许遣使吊丧，司马氏宗室无诏不得擅自入京，同时免除了谯王司马尚之、司马休之兄弟俩的禁军将军职位，赶回谯郡封地。
自此，各地诸侯王与州牧刺史都不敢再生异心……
不日，会稽城破，内史王凝之被杀，夫人谢道韫被俘的败报自南方传来，晋廷大震，王恭欲催促谢琰进兵，徐宗文反对。黄门郎王献之得知兄嫂遇难，即刻亲往徐府拜见徐宗文。
“将军，家兄与家嫂不幸遭遇此难，听闻谢瑗度的主力已经攻破武康，切断了孙恩粮道，正屯兵钱唐，距离会稽近在咫尺，请将军下令命其起兵东向，解救家嫂！”王献之从前多住谢府，与徐宗文也算是熟识，所以也不藏私，一见到徐宗文便打开天窗说亮话，直言来意。
徐宗文让王献之落座，安慰道：“子敬莫慌，谢道韫一向有才名闻世，深得会稽民心，且其坚毅，不爱红装爱武装，有荀灌娘之风，谅孙恩也不敢将其如何，请子敬莫要焦灼！”
荀灌娘是平南将军荀崧之女，建兴三年（315年），荀崧守宛城，城中几乎粮尽的时候，荀崧打算派人到襄阳求援。当时年仅十三岁的荀灌主动请缨出城求援。荀灌带领十几个勇士，穿越敌军的重重包围，到达襄阳，求得援军以解宛城之围，被赞誉为烈女。
“可是嫂嫂毕竟是一介女流，孙恩可是杀人不眨眼的反贼！”王献之仍不放心，天师道之乱闹得太凶，听说孙恩已经拥兵十万，要是他起了杀心，谁能阻挡？
徐宗文坚持主见：“将在外君令有所不受，何况是徐某的军令？我等皆在建康，对会稽、钱唐局势并不清楚，如何决断，如何进军应当