消灭了张楚后，章邯把主要目标对准了楚国，项梁战败身亡，对楚国造成了重创。章邯便认为楚军已无大碍，转而将注意力转向赵国。
而王离南下后，先击败了赵王武臣的军队，又招降了赵国的将领李良，消灭了赵军主力。然后他带兵南下，要和章邯合军攻打楚国。偏偏章邯的策略是暂时放弃楚国，他要把目标转向北方的赵国，而王离却坚持攻打楚国国都彭城和周边郡县。
最后两军分道扬镳，章邯率领大军北上，连续击败了赵国大将陈余和相国张耳，逼迫赵王率领残军逃入了巨鹿城固守。
由于王离没有听从指挥，迟迟未北上与章邯汇合，章邯只好给王离施加压力，迫使王离将主力抽调到巨鹿。这就给了楚怀王一个喘息的机会，沛公出征一开始就以几千人的部队打败了王离的长城兵团，这只能说明了他打败的是王离急于北上的后军。基本上是赶跑了事。
再来看章邯的安排，他让王离这十五万大军围攻巨鹿，自己近三十多万大军负责修建、保护甬道，维系粮草安全。
眼睁睁看着王离与项羽激战，章邯没有出兵相助。是章邯的不愿意还是出于王离的拒绝？虽然后面曾派兵救援，但都被项羽打退，要知道项羽总共才五万人，章邯打不过就算了，还不顾王离的死活退兵，导致王离全军覆没。
这之间二将是否有争功的嫌疑不好说，但矛盾肯定是落下了。再说朝廷内部赵高和李斯之间的争斗也愈演愈烈。这对前线将士的影响也是难免的。李由战死、李斯灭族等一系列乱象都在这期间发生。
朝廷内乱，严重打击了秦军的士气，章邯在李斯被杀后，感察到一股寒气从脚底升起。李斯在丞相岗位的时期，全面主持秦始皇陵墓的修建工作，而章邯是具体负责骊山工程的主管。可以想象，章邯必须是李斯信的过的人，否则到不了这个位置。
章邯临危受命负责阻击周章叛军的时候，李斯尚在掌权时期，对章邯的支援力度很大，虽然二世同样很信任章邯，但赵高能否像过去一样继续支持自己，章邯没有把握。
正当章邯与反秦联军激烈争战的时候，李斯被捕下狱，章邯突然兵败东阿，是否已经有了拥兵自保的想法，这个不得而知。但是，赵高把持朝政的事情，章邯早有所闻，既然李斯都能被害，章邯作为外将，难保不被赵高猜疑。
章邯很清楚，必须保留手中的军队作为与赵高博弈的资本，否则下场可能比李斯还要悲惨。
秦廷大员之间的关系，孰是孰非，众说纷纭，只