杨秀清和麾下数十名高级将领不是战死就是失踪，直接导致了五万主力的土崩瓦解，失去了统一指挥的太平军再拧不成一股绳，有要继续进攻湖南的，有要北上和李秀成的北路军汇合的，也有东返和韦俊的南路军合击的，更有人提出要原路返回九江，一时间，众说纷纭，谁也指挥不了谁，最后引发了大规模哗变，五万大军分成了三股，一路北上，一路东进，一路原路返回九江，杨秀清进攻湖南的战略意图彻底破产。
在接到杨秀清失踪的消息后，韦俊便知道不但攻掠湖南、砸断湘军和湖广绿营脊梁的战略构想破产，甚至连截夺湖广粮仓的计划都将付诸东流了！没有了粮草补给，他的四万大军根本不可能在恩江坚持太久！
就在接到消息的当晚，韦俊所部主动后撤，一路退回九江，曾国荃尾随跟进，光复江西大部州府。东进欲和韦俊所部汇合的杨秀清旧部在没有任何警觉的情况下闯进曾国荃预先摆好的包围圈，遭受湘军四面围攻，经一昼夜激战，等韦俊率援军抵达时，一万余人已经全军覆灭。
韦俊率部和曾国荃混战一场，双方互有死伤，都各自退兵。
杨秀清失踪，韦俊退兵，引起了连锁反应，远在武昌的李秀成认为，杨秀清失踪极可能被俘的事实已经沉重地打击了太平军的士气，一旦九江失守，他的北路大军顿时就要被截断归路！与其到时候为了杀开血路而损兵折将、狼狈后撤，倒不如趁现在占尽优势时主动后撤！
李秀成当机立断，连夜撤军。
不想忙中出错，竟然取道白露洲近路，被左宗棠故伎重施，命令隐藏在白露洲左侧内湖的庞清所部死死卡住鄂州，李秀成所部再度被合围在白露洲上，遭受湖广绿营的前后夹击。
幸好周国虞的水师一举击败周公望的绿营水师，将李秀成的大军从长江水路接走，但在周国虞到来之前，北路军在两面夹击下已经损失惨重，包括留守断后的两千敢死队在内，折损了将近一万人。
等到十二月底，出征的各路大军陆续返回九江时，在湘军和湖广绿营的合力围攻之下，杨秀清带来的十万大军已经折损近半，将近六万人挤在九江城里，军心涣散、士气低落，放眼整个西线，太平天国已经只剩下了九江这个桥头堡，并且处于风雨飘摇之中，随时都可能被湘军和湖广绿营联手击破
转眼之间，太平天国在西线的局势便从顶峰跌到了谷低。