1857年7月，韦昌辉在石达开的支持下发动兵变，洪秀全被软禁起来，两个哥哥福王和勇王惨遭灭门！整个太平天国的大权落入韦昌辉之手。韦昌辉和石达开以铁血的手段整肃天京，一大批忠于天王的将领遭到了清洗，虽然太平军的力量遭受了一定的削弱，但是最高领导层却获得了脱胎换骨的变化，从原来的贪图享受、不思进取转而开始励精图治、积极进取。
就在太平天国内部爆发天京兵变之时，秦汉的新军也和曾国荃的湘军发生了第一次摩擦。
有了前次被秦汉截夺军火的经历，曾国荃决定派兵进驻武汉，以武力夺取武汉军械制造局的控制权，秦汉在获知消息后针锋相对，决定派长沙卫戍师的第一团进军湖北，准备以武力抗拒湘军进驻武汉。
湘军的主将是石镇海，此人乃是曾国荃麾下一员猛将，打仗素来不怕死，每战必冲在最前面，当兵时如此，当了营官之后还是如此，为此曾国荃还曾数次批评与他，可石镇海仍旧我行我素，浑不将主帅的话放在心里。
正所谓有其将必有其兵，石镇海骁勇，镇字营的湘军官兵也像主将一般、个个剽悍成性，委实堪称一支虎狼之师，论战斗力和秦汉以前领率的六营应在伯仲之间。但秦汉根本就没有将这支湘军放在眼里。
理由很简单，长沙卫戍师第一团虽然只是刚组建不久的新军，作战经验缺乏，但这支军队是以湘楚军校的学员为骨干组建的！这些学员可不是普通的学员，他们经过湘楚军校将近半年的培训，已经完全接受了近代陆战的战术思想，他们还深受西方资产阶级大革命的影响，已经和以前的绿营旧军截然不同了。
相比较湘军采取的重金激励手段，秦汉在新军中采取的洗脑策略显然更胜一筹，被激发出强烈爱国热情的学员根本不将个人的利益放在心上，他们的脑子里只有一个强烈的念头，中华民族是个伟大的民族，绝不能听任洋人的欺凌！而要抵御洋人的欺凌，依靠腐败的满清政府是绝无可能的，唯一的可能就是学习西方世界，在中华大地来一次轰轰烈烈的大革命。
秦汉非常自信，以思想武器武装起来的新军，战斗力是绝对要高过以金钱诱惑武装起来的旧军的。更何况，长沙卫戍师还装备了相对优良的武器装备，步枪和投掷弹已经成为制式武器，士兵基本做到人手一杆枪、五颗投掷弹。
秦汉甚至还额外组建了一个师属骑兵营和师属炮营。
但这些都不是新军最大的优势，新军最大的优势其实就在秦汉本人！秦汉本人来自二