知王、刘二人已是王八吃秤砣，铁了心，不论大伙怎么劝，皆是不肯答应。消息不胫而走，一时间，城中百姓群情激愤，汹汹咸集于府前，要求他们尽快献印投降。见民心难违，二人走投无路，遂将大印挂于胸前，在府衙大堂上悬梁自尽，大西军旋即占据了永昌。
由于沐家世镇云南，在军卫和土司中享有很高的威望，孙可望因此并没有收缴沐天波那枚世代相传的“征南将军印”，而是让他行文招抚各地土司。
在沐天波的号召下，顺宁、蒙化、金齿等土司皆次第来归，只有东川土司禄万亿和禄万兆兄弟二人尚在观望，不肯投降。
至此，云南十八府，除蒙自、阿迷州、东川以外，尽皆平定，混乱已久的云南局势，终于尘埃落定。
紧接着，孙可望又选派官吏前往各地赴任，并于沿途设置马塘，军中、地方旦有飞报公文，一昼夜便可到达昆明。
大势已定，孙可望于是留下都督王复臣驻守干崖、陇川一带，自率大军携黔国公沐天波以及杨畏知等新附之臣，东返昆明。
回到昆明后，孙可望当即传谕全滇，曰：“孤率三兄弟，统百万貔貅，平定云贵！今建国不建统，纪年不纪号，惟愿与黔国公沐氏携手共扶明后，恢复江山！”
紧接着孙可望又重新任命了内阁及六部各级官员，在安西元帅李定国、抚南元帅刘文秀以下，仍封沐天波为黔国公，提调土汉官兵，加云鹤服色；杨畏知为华英殿大学士兼都察院左都御史；并以严似祖为吏部尚书兼礼部尚书，丁序焜为户部尚书，任僎为兵部尚书，雷跃龙为刑部尚书，王应龙为工部尚书；张虎为锦衣卫指挥使，马兆熙为学院。
同时调整地方各级政权结构，滇黔二省的地方官皆由孙可望亲自委任。鉴于云南初定，大西军另在贵州设立行营，分兵屯驻各地，又收编诸土司之兵数万人，一时间大西军兵马强盛，精锐之兵近二十万。
八月初，孙可望开始在昆明城中营建王府，他命人拆毁呈贡县城砖石以为宫墙，脚宽六尺有余，并僭越使用黄瓦红墙，殿悬五龙，陛雕盘螭。另在宫门外设通政司，立下马牌，置天子仪仗，一切皆参照皇家标准。除此之外，还在城郊建太庙祭祀张献忠，凡有大事必先告之于太庙。
直到这时，沐天波方才发现孙可望根本就没把大明朝廷放在眼中，打的是扶明抗清的旗号，行的却是割据一方之事，与沙定洲相比，竟有过之而不及。无奈黔国公府的实力经过沙定洲之乱，早已不同往日，为了不给自己招惹灾祸，沐天波惟