定国回到云南后立即招募新兵三万人，日夜操练兵马，打造兵器盔甲，随时做好北伐准备，又命马兆熙在昆明主持会试。
试毕，诸生聚集于安西王府前拜谢恩典，定国吩咐左右每人赏钱三百串，并当场大声宣布道：“诸位且回家用心读书，静候佳音，不日大军北伐，收复失地，尔等便是父母官了！”
诸生再次谢恩，旋即各自散去。
再说去岁清军兵分两路大举南下，其中尚可喜与耿仲明一路尚未出发便陡生变故，有人控告耿仲明窝藏逃犯，耿仲明竟畏罪自杀。为不影响军心，清廷于是命其子耿继茂继承父爵，代父出征，协助尚可喜攻略广东。
永历四年十一月，广州沦陷，尚可喜与耿继茂屠杀广州军民七十余万。
而孔有德一路，则在湖南与广西交界处的龙虎关与明朝永国公曹志建部展开了拉锯战，双方激战一月有余，明军抵挡不住，连失龙虎关、灌阳、恭城等地，兵马折损过半，曹志建不得不带着残部退入深山之中。
拿下龙虎关后，桂林门户大开，孔有德遂分出一路兵马，取道全州，攻打严关，对桂林形成夹击之势。
不久，全州陷落，严关也随之失守，前线溃退下来的明军，沿途掳掠，桂林城内秩序顿时大乱。
形势危若累卵，然而瞿式耜自忖上次自己力排众议，坚持不退，硬是守住了桂林，这次见城中明军数量还有不少，又有卫国公胡一青、新兴侯赵印选、武陵侯杨国栋、宁远伯王永祚、绥宁伯蒲缨、宁武伯马养麟等一干悍将，于是决定故技重施，据城死守。
为此，瞿式耜一面竭力筹措粮饷，一面鼓励诸将备战。哪曾想，这些养尊处优的公侯伯爵们早已成了惊弓之鸟，根本毫无斗志可言。
十一月初五日，从兴安传来塘报，说清军即将逼近桂林。瞿式耜急令新兴侯赵印选领兵出城，扼险防守，以为桂林屏障。
谁知前两年还在桂林保卫战中奋勇杀敌，屡败清军的赵印选此番见清军势大，不但畏缩不前，还与胡一青、王永祚、蒲缨、杨国栋、马养麟等人密谋，带着部众及家眷，抛下瞿式耜，弃城向西逃窜。
瞿式耜瞬间成了孤家寡人，他不禁气愤至极，捶胸顿足道：“国家把高官厚禄给尔等，百姓拿民脂民膏养尔等，今遂作如此散场乎？可耻！可耻！”
侍从武官见形势愈发危急，连忙备马请瞿式耜出城暂避，并劝说道：“大人乃是国家栋梁，一身关系国家安危，一旦突围出去，仍可号召四方豪杰，卷土