根据设计和使用资料将命令转化为指令、代码等电子信号，然后由核心舱执行。
“录入外接设备。调取鱼龙资料夹设备的驱动资料库。”整个系统对接需要按照一定的顺序来，但不能完全依靠软件程序。鱼龙号是生物星舰，其中一部分的控制“代码”其实是以神经记忆、条件反射和脑神经连接的方式存在的。核心舱从来就不是为了生物星舰设计，提前设计的对接和驱动程序，不能保证一定和生物体完美配合。艾瑞克斯在这个时候居中协调，他的大脑通过通讯中枢来协调鱼龙的神经系统，他的脑控体通过脑池的信息通道来修正核心舱的操作系统，这样才能尽快让双方找到共同点。先把电子手和血肉爪握起来，升起引力屏障护盾，再考虑怎么握得更舒服等问题。
---能量线路打通，核心舱系统完成线路自检，与设计图完全相符。---
---通讯链路完成自检，山河社稷号设备通讯协议已完成加载，鱼龙号生物信号协议正在试运行——该工作负责人：研究员人工智能。---
---数据和控制总线，系统加载协调中。警告，经过自检，该总线并非精确控制总线，需要外部系统进行辅助。核心舱系统不能完全保证该总线的安全性和有效性。---
这个警告是正常的。鱼龙号必须从舰桥进行控制，艾瑞克斯一直就没打算让核心舱的系统插手这件事。他对核心舱的要求是能够执行从舰桥传过来的命令，包括验证艾瑞克斯的身份，修改一些功能模块（特别是引力屏障）的工作状态。核心舱的系统尽可能少动，日常的事情交给鱼龙号就可以。
只不过核心舱的系统从设计之初就没考虑过成为其他系统的“下属”，独立性一直是首先考虑并贯彻始终的，因此这方面需要做出的妥协很多。虽然事先做了很多准备，但实际对接时各种各样的情况都会出现。
一个生物总是不喜欢被程序控制头脑，而电子程序也不喜欢大脑那种多变的状态，尤其是大脑会提出“五彩斑斓黑”这种要求，是程序最不能接受的。
艾瑞克斯将这个磨合的过程看作一次脑控体安装手术，然后用自己丰富的经验去解决各种问题。他尽可能按照计划来，但也需要大量临场发挥，甚至做出一些颠覆性的改变，好让系统在最快的时间内上线。
一个兵马俑被摧毁了，“空白总管”收拾收拾，又把下一个兵马俑“送进火坑”。躺在脑池连机器里的艾瑞克斯一动不动，但他面前显示系统情况的全息投影乱成一团。生物神经信号可不是一排