作战方案很快确定下来，郑家军出动两万五千将士征伐旅顺和双岛，留下一万将士驻守淮安，有关谁指挥这次作战的事宜，在小范围之内引发了极大的争论，郑勋睿坚持亲自指挥，毕竟这是一次非同寻常的战斗，而且意味深长，从这次的战斗开始，郑勋睿不仅仅是为了大明王朝而战，也是为了自身的将来作战。
郑勋睿的深意，郑锦宏和徐望华都是难以理解的，所以他们是极力反对。
郑勋睿出任漕运总督的时间不长，而且对漕运进行了大规模的整顿，如今正是需要平稳过渡的时间，这个时候需要郑勋睿驻守在淮安，稳定各方面的局势，再说远赴旅顺和双岛作战，存在很大的危险性，这是一次没有后援的战斗，作战的每一步都是危险重重，要做好精心的部署，稍有不慎就可能酿成大祸。
如此的情况下，郑锦宏和徐望华自然是反对郑勋睿亲自指挥作战。
郑勋睿有其自身的想法，多方面的原因促使他必须要亲自挂帅。
首先从作战的特殊性方面考虑，这是一次缺乏后援支持的作战，从已经被后金鞑子占领的地方，硬生生的开辟出来一片天地，面临的复杂局面可想而知，这样重要的战斗，他必须亲自指挥，依照他的威望，能够迅速贯彻各项的作战部署，最大限度的保证作战的胜利。
其次是从面临的险恶情况考虑，郑家军一旦占据了旅顺和双岛，肯定会面临后金鞑子的疯狂反扑，这个时候被动防守是行不通的，必须要杀出去，主动面对后金鞑子的反扑。甚至是发动主动的攻击，彻底打灭后金鞑子的嚣张气焰，如此才能够护卫住双岛和旅顺。
再次是从战斗的保密性和突然性方面考虑，应该说此次进攻旅顺和双岛，完全出乎了皇太极的预料，甚至朝中的大人都想不到这一点。皇太极已经率领大军在朝鲜鏖战，济尔哈朗驻守沈阳，多铎、阿济格和阿巴泰等人驻守盖州，旅顺和双岛不是后金鞑子防御的重点区域，所以使用闪电战的方式拿下旅顺和双岛，就显得至关重要。
最后是从后勤供给方面考虑，一旦郑家军拿下了旅顺和双岛，就必须要保证牢牢控制蓬莱城，控制驻扎在蓬莱的水师。这样才能够保证旅顺和双岛的供给，想要真正的控制蓬莱城，控制驻扎在蓬莱城的水师，只有郑勋睿亲自出面。
这一系列的理由，促使郑勋睿必须亲自挂帅。
可凡事有利有弊，郑勋睿亲自挂帅，存在的弊端也是明显，这就是郑锦宏和徐望华等人说到的漕运的事宜。
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