最终拍板，做出决定，要求司礼监太监参与朝会并针对朝政提出意见建议，朱由检甚至还准备为司礼监太监参与朝会下发圣旨，将这件事情完全明确下来，今后都照此执行，被司礼监大太监王承恩劝阻了。
激烈的争吵之中，朱由检始终掌控局势，有了司礼监太监参与朝会，他产生了强大的自信，也能够冷静的分析出来文武大臣的心思了。
两天的朝会结束，朱由检也做出了最终的决定。
崇祯十四年六月二十日，皇上下旨。
原内阁首辅周延儒、原内阁次辅张凤翼、原内阁大臣杨一鹏因为身体原因致仕；原内阁大臣、兵部尚书杨嗣昌，因开封府城陷落之事免去一切职务；已经阵亡的原兵部尚书、右副都御使、五省总督孙传庭，因指挥大军作战出现重大失误，剥夺一切的名爵；阵亡的原河南巡抚吴甡，未能很好的护卫开封府城，本应遭受惩戒，不过其拼死守卫开封府城，效忠朝廷，此等精神应该嘉奖，赐予太子少保之职衔，着令厚葬；原河南总兵贺人龙，未能履行职能，免去其河南总兵职务，交由兵部和大理寺审讯。
内阁大臣钱士升出任内阁首辅，内阁大臣陈新甲出任内阁次辅。
工部右侍郎张溥出任河南巡抚，即刻上任，主持河南局势，包括调遣军队事宜；右佥都御史张采出任兵部右侍郎；右佥都御史张采出任户部右侍郎；大理寺右寺丞吴昌时出任都察院左佥都御史；詹事府右渝德龚鼎孳出任都察院右佥都御史。
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圣旨出来之后，举朝震惊。
两起两落的周延儒，准备回到家乡去了，其实他的年纪并不是很大，以身体原因致仕，这有些说不过去，不过对于内阁首辅的职位，周延儒已经没有任何的眷念了。
朝中的局势已经完全明确，皇上的心思已经表露无遗，自此之后，朝中的局势将会出现重大的变故，这一点是在周延儒的预料之中的。
大明江山自此之后，将出现三个重大的对手，郑勋睿和郑家军成为了大明王朝最大的对手，其次就是后金鞑子，最后是流寇，从大明朝廷的实力方面来看，无法战胜任何的一个对手，而且皇上已经将郑勋睿和郑家军作为了最大的对手，在内阁的调整方面，包括朝廷大臣的调整方面，重用了郑勋睿的死对头。
内阁此次的调整很大，他周延儒、张凤翼、杨嗣昌和杨一鹏等人都离开了内阁，新任的内阁首辅和内阁次辅都是曾经的内阁大臣，按说需要补充不少人进入内阁的，皇上对这件事情没有马上做