瑞元四年五月，经过了一个多月的航行，大明水师的战船，以及一百艘满载货物的商船，终于抵达了日本，杨贺做出了安排部署，两万水师将士出战，一万水师将士守卫战船和商船，而接下来的战斗，用杨贺的话语来形容，那就是砍瓜切菜。
日本幕府统治，其实就是军人统治国家，集中起来的军人形成幕府，凌驾于文官集团之上，决定国家的一切事宜，幕府在形式上面取得天皇的授权，但天皇没有任何的权力，这种幕府的统治，说到底就是军人挟天子以令诸侯。
德川家族的幕府，力量最为强大，故而德川家康出任了代表军人最高职位的征夷大将军，可惜的是，其他的家族不一定会完全听从德川家族的话语，毕竟这些家族也是有着很不错军事实力的，虽然这些家族名义上是幕府的藩国，可是藩国之内的所有事情，德川家康不一定能够干涉，所以说德川家族名义上统治整个的日本，其实真正能够统治的地方，只有日本整个领土的四分之一。
幕府的统治，有优点，但是缺点更加突出，那就是难以形成真正的合力，一旦遭遇外界的入侵和打击，以军人集团为首的权力阶层，不管是幕府还是藩国，因为各自的需求不一致，极容易造成分化的局面，他们不可能团结一致对外，甚至可能内部就出现分裂。
郑芝龙是了日本幕府统治内幕的，不过皇上更加了解。
登陆之后，杨贺严格按照皇上旨意的要求开始作战，凡是遇见抵御的藩国军队，水师将士毫不留情的打击，那些愿意与大明朝廷交易的藩国。杨贺则是按照郑芝龙的建议，甚至直接派遣郑芝龙与对方商谈交易。
水师出发之前，徐望华曾经建议派遣文官跟随，但这个建议遭到了周延儒等人的反对，他们认为郑芝龙其实就是文官，现在是户部郎中。若是另外派遣文官，不熟悉日本的事情，做出的决定若是不合适，可能造成不好的影响。
徐望华也想明白了，没有坚持自身的意见。
故而所有出面商议的事情，都是郑芝龙负责的。
水师的目标是江户。
江户是德川家族所在地，也是幕府所在地，征夷大将军德川家康就在江户，日本的天皇也是在江户。天皇是名义上的日本的领袖，不过真正的领袖是出任征夷大将军的德川家康。
水师不会过分的打击幕府之下的其他藩国，但一定要彻底剿灭德川家族，按照皇上的要求，将政权还给日本的天皇。
严格说，日本天皇根本无法真正的统领整个日