南京的孙传庭知道这消息后，顿时大怒，在内阁会议上痛骂了一顿左良玉。不过他并没有惊慌失措，因为对这事早有布置。他马上以朝廷的名义起草了份讨伐檄文，并在通报曹越后，调留守长江一线的三个近卫师，沿江西进，准备讨伐左良玉。
卫戍南京的两个近卫师并没有动作，依然驻囤南京。
随后，大明朝廷向天下广发勤王诏令，要附近的镇军不得与左良玉苟合，并将左良玉所领的湖北军视作敌人。诏令中同时劝诫湖北军的将士，不要做出大逆不道的事，如果他们不追随左良玉叛乱，迷途知返，朝廷不会责他们的罪。但要是继续和左良玉一条道走到黑，那定严惩不怠。
曹越在收到消息后冷笑一声，马上就传令已经待命许久的红娘子部，依计划向湖北进军，准备消灭左良玉部，同时传令留守南京江北的几个近卫师，狠狠打击左良玉部，在最短的时间内平定叛乱，决不能让左良玉的叛乱祸及更多地方。
曹越同时传密信给南京的孙传庭，要他密切注意朝堂上众官员的动向，防止朝中官员暗中支持左良玉。他再令锦衣卫的常延龄、曹超等人，严密监视南京城内的一举一动，避免有人趁机作乱。他再给钱谦益、吕大器、方以智等人密令，要他们发动东林党、复社成员，群起声讨左良玉的叛乱。
虽然说以前的周皇后现在的周太后及小皇帝朱慈炯的身份南京官员基本没有怀疑，但左良玉打出了“清君侧”的旗号，说朱慈炯是假冒的，周太后是被曹越所迫，那就必须要做出应对，掌握天下言论，避免不明真相的军是被左良玉蛊惑，南京城内的言论必须要控制。东林党和复社的作用也要发挥出来。还有，周太后及那些有幸逃出北京的皇室成员，还有朱媺娖这些最能证明朱慈炯身份的人也要站出来表态。尽量孤立左良玉。
《大明近卫军报》也要用更多的版面报道这件事，将左良玉那些见不得人的事都报道出来，并隐指其得到建奴的支持才有胆量造反。
“大明王师与建奴正在聊城血战，逆贼左良玉竟然趁机作乱，与建奴苟合，甘愿与吴三桂、唐通等人同流合污，妄图将大明江山献与外虏，几万万大明军民定不会答应。所有有血性的大明军民。拿起你们手中的武器，以最大的决心、饱满的信心与一切反明反力做斗争!”近卫军报大大的红字檄文将军方的态度完全表明，许多人正是看到了军报的檄文，被里面的内容鼓动，加入大明近卫军的行列。
在曹越率军北伐后，大明近卫军的募兵工作一直在进行，规