火影猿飞老师，但是，他突然死去了，自来也也是有一种说不出去的滋味和感觉。
于是在接到晓组织的情报的时候，潜入了雨之国雨隐村探查。雨隐村可是晓组织的老巢之一，这里边待着的可是号称忍界最强男人的轮回眼的拥有着漩涡长门！自来也情报太少，在小南和长门的攻击下，很快，自来也不敌，死去了。
木叶。接到自来也的情报和死讯后，木叶都陷入了巨大的悲痛中，漩涡鸣人下定决心，要打败晓组织，于是前往了妙木山跟蛤蟆仙人学习仙人模式。
宇智波佐助一出来，就组织好队伍，搜寻晓组织的据点，试图找出宇智波鼬并复仇。在一处山洞里的晓的据点，宇智波鼬约定与佐助在宇智波的一处驻地进行*********在大厅里，宇智波鼬先是与宇智波佐助进行幻术对决，佐助从中得知了宇智波斑的消息。接着，两人进行了忍术对决，宇智波佐助终于见识到了万花筒写轮眼的威力，并在宇智波鼬的帮助下，封印了大蛇丸，并且，宇智波佐助还觉醒了万花筒写轮眼。
但是佐助没有像宇智波鼬所想的那样，回到木叶变成木叶的英雄，反而在宇智波的诱导下，与木叶与团藏为敌，加入了晓组织并参与了尾兽捕捉的行动。