陕兵与闯军决战的一个月前，八月初，王来兴率军溯大江直抵夔州府。而此时，早先流窜入川的张献忠已经率军攻克瞿塘关、占领奉节县与瞿塘卫。
在覃奇功的授意下，夔州府境内谭弘、谭文、谭诣三兄弟收拢兵力，与覃奇功所部往达州方向退避，因此沿江云阳县、万县等地守备空虚，张献忠得以驱兵猛进，直达万县。
川中动‘乱日久，各地军镇拥兵自雄。为了筹措军饷，各自拟定条例税率强行加赋，剥榨百姓。百姓不堪其苦，遂多揭竿而起，有剽悍者则勇于主动发动攻击，即所谓早期的“打衙蠹”到如今的“除五蠹”。
所谓“五蠹”，“一曰衙蠹，谓州县吏胥快皂也；二曰府蠹，谓投献王府、武断乡曲者也；三曰豪蠹，谓民间强悍者也；四曰宦蠹，谓缙绅家义男作威者也；五曰学蠹，谓生员之喜事害人者也”，百姓结社攻击胥吏衙役、绅衿子弟、王府爪牙等辈，至今风气愈加炽热，又因为饥寒，更开始大肆抄掠富户，官府屡镇不绝。
张献忠显然对此次入川非常重视，利用此等地方矛盾，并没有继续冒进，而是抓住机会原地整军经武，继续增强自己的实力。除了沿途裹挟百姓之外，更是四出派人游说社团入伙。他的威名在四川甚著，投效依附之众一时云凑，仅仅半个月不到，屯驻万县的西军规模重新扩充到近三万人。
王来兴后续前往达州与覃奇功及三谭会合，聚兵一万三千，观望不前。张献忠见赵营兵马逡巡，同样稳坐钓鱼台。
直到八月中下旬，僵持局势为四川巡抚陈士奇打破。
陈士奇早前做梦也想不到，西军有朝一日还能冲破南直隶、湖广两道屏障，重返四川。他大惊失色，在成都与蜀王朱至澍紧急磋商，最后决定亲临重庆府指挥剿灭西军的战事。四川大小军阀，他能指挥得动的不多，好歹抽调了标营副将卞显爵、威武营参将曾英、汉羌兵备道标下坐营都司赵‘荣贵两部为主力分别从成都、川陕边界赶赴重庆，并传令川东道参政刘麟长、石砫二品诰命夫人秦良玉等部同率军往重庆听命。除此之外，檄告各府、州、县官加强当地防御，有城的严守城池，没城的乡村修堡寨相望守护。
匆忙抵达重庆府城后，西军仍自岿然不动，陈士奇赶紧布防，先将重庆府大江南岸和嘉陵江北岸的船只全部集中到府城周边，断绝两江交通，阻碍西军进击。而后又认为西军走水路沿江攻重庆府城必经铜锣峡，遂投入重兵防御下游门户铜锣峡。同时严控佛图关，预防西军从陆路侵犯府城。他这一系列布