正董卓行为，虽未完全听从，也有所矫正，却成同党。这是不公平的。若后世将冤杀蔡邕具实秉书，也不能算诽谤吧！”
王允后悔莫及，但已晚矣。
果然，后世文人还是把王允错杀蔡邕这段史实流传下来。
话说吕布诛杀了董卓，派遣李肃以皇帝诏命率兵诛杀屯兵在陕西的董卓女婿牛辅。
牛辅率兵迎战，李肃不敌，败退弘农。
吕布大怒，以“挫军锐气”将其斩首，悬头军门。
牛辅军营夜间哗变，慌忙携带金银珠宝，领着胡赤儿五六个亲随逃往城北渡河。
胡赤儿等人贪图钱财，杀了牛辅，将首级送往长安献给吕布。
吕布问起情由，跟随的人说是胡赤儿夺取金宝谋杀牛辅。
吕布当即将胡赤儿诛杀，劝说王允乘机追剿凉州董卓旧部。
王允在如何处理其旧部时，极不慎重，反复无常，先是想全部赦免董卓部下，可继而又对群臣解释说：“本来想赦免他们。因为只是身不由己，不得已听从董卓差遣，跟随董卓。现在如果给他们突然加上恶逆的罪名，而且特定赦免他们，恐怕反而使他们猜疑恐惧，心理承受不了。所以，赦免他们无罪不是使他们安心的上上之策，还不如让他们承受惩罚。”
吕布又想把董卓财物赏赐公卿、将校，王允又不准。
王允平日看不起吕布，以剑客对待他。
吕布却认为自己有功劳，自吹自擂，既不得意，渐与王允不和。
凉州军队是董卓嫡系部队，战斗力强，而且忠心于董卓。
如何处置董卓旧部，是关系王允本人及东汉政权的大事。
王允企图削夺凉州将领兵权，取缔全部凉州兵，由关东官兵去控制。
后来有人对王允说：“凉州兵素来害怕袁绍，畏惧关东官兵，如果派关东官兵去收编，凉州兵人人都会担心性命不保，很容易引起兵变。不如任命皇甫嵩去担任凉州兵统帅，并长期留在凉州，以便安抚军心。”
王允坚决反对：“这样绝对不行。关东官兵是反董卓义军，与我们同一战线。现在董卓已死，如果董卓旧部继续屯驻险恶之地，虽然安抚了凉州军队，但关东官兵将领会疑为慢待，以至心灰意冷。”
李傕、郭汜、张济、樊稠等董卓旧部率兵屯驻陈留、颍川诸县，闻董卓死讯，回到陕西。
牛辅已死，无所依从，又闻长安城中凉州人尽被诛杀，只得拥兵自守，却又不见朝廷赦免